Karlov için ilk cenaze töreni Rusya Dışişleri Bakanlığı'nda düzenlendi. Dışişleri Bakanlığı ana binasındaki törene, Rusya Devlet Başkanı Vladimir Putin, Başbakan Dmitriy Medvedev, Federasyon Konseyi Başkanı Valentina Matviyenko, Dışişleri Bakanı Sergey Lavrov, bakanlık çalışanları, siyasi parti liderleri ile Karlov'un ailesi ve yakınları katıldı.
Törende Putin, Karlov'un naaşının bulunduğu tabuta çiçek bıraktı. Rusya Devlet Başkanı daha sonra da Karlov'un ailesine taziyelerini iletti. Törende konuşma yapan Dışişleri Bakanı Sergey Lavrov ise Karlov'a "kahraman" ünvanı verildiğini vurguladı.
Lavrov; hayatını kaybeden Rus Büyükelçinin heykelinin dikilmesi için teklifte bulunduklarını ifade etti. Karlov'un naaşı, Dışişleri Bakanlığı'nın ardından dini tören için Kurtarıcı İsa Katedrali'ne götürüldü. Rusya Başbakanı Medvedev de törende hazır bulundu.